機關單位指政府部門、行政單位，是國家為行使其職能而設立的各種機構，專司國家權力和國家管理職能的組織;事業單位則是國家基于公共目的成立的公共事業組織，是指由政府利用國有資產設立的，從事教育、科技、文化、衛生等活動的社會服務組織。

機關單位是負責對國家各項行政事務進行組織、管理和指揮；而事業單位是為了社會的公益目的從事教育、文化、衛生、科技等活動。

機關單位使用行政編制、由國家行政經費負擔；事業單位使用事業編制，由國家事業經費負擔。